به گزارش سینماخانه و به نقل از پایگاه اطلاع‌رسانی سیما، این مستند با حضور در شهرها و مکان های ثبت شده، رد پای تاریخ را دنبال می کند و در این راه از روایت شخصیت های عصر پهلوی دوم مثل خاطرات ارتشبد حسین فردوست و دست اندر کاران نظام سابق، همین طور روایت نیروهای چپ در شناسایی خط وابستگی به آمریکا و بسط و گسترش این خط در قبل از انقلاب استفاده شده است.در «سایه های پنهان»  بخشهایی از تاریخ معاصر مثل تبعید رضا شاه، اشغال آبادان و انتقال گسترده سلاح های سنگین و هواپیماهای آمریکایی به آبادان و ارسال آنها به روسیه، کنفرانس تهران و پایان جنگ دوم جهانی، بازدید روزولت از نظامیان مستقر در تهران و سفر شاه به آمریکا در زمان ترومن مرور کوتاهی دارد و موج اول خرید های نظامی از آمریکا ، گسترش و بسط سیستم مستشاری در عرصه های کشاورزی، اصلاحات ارضی، کاپیتالاسیون و آغاز نهضت ضدآمریکایی آیت الله خمینی ، شوک نفتی ۱۹۷۳ موج دوم خرید های تسلیحات پیشرفته تر آمریکایی توسط شاه و .. بررسی می شوند.

مجموعه مستند «سایه‌های پنهان» یکشنبه تا چهارشنبه ساعت ۱۸:۰۰ از شبکه مستند سیما پخش می شود و تکرار آن روز بعد ساعت ۵:۰۰ روی آنتن می رود.